2001年4月3日，日本政府篡改历史的教科书 引起中、朝、韩等国的强烈愤慨。
    4月3日，日本政府通过了篡改历史、美化侵略的教科书，立即引起中国、朝鲜、韩国等历史上饱受日本侵略国家的强烈愤慨，各国政府纷纷表示抗议。这本美化日本侵略、歪曲历史事实的中学历史教科书，由扶桑社出版，在2000年送审，由日本文部科学省在2001年4月审批通过，定于2002年使用。此事激起了中国、朝鲜、韩国、东南亚各国以及世界正义人士的强烈谴责和抗议，在日本国内也受到广大有识之士的激烈反对。
    早在2001年3月初，中国外交部副部长王毅就向日本驻华使馆临时代办就日本历史教科书问题严正表明中方立场。他指出，日本教科书问题的实质，是日方“能否真正正确认识和对待过去侵略历史的问题”，宣扬“皇国史观”和美化侵略的历史教科书若获通过，“必将损害刚刚进入新世纪的日中关系”。

    2001年8月13日，小泉执意参拜靖国神社亚洲人民表示强烈愤慨。
    日本首相小泉纯一郎无视日本国内和国际舆论的反对，于2001年8月13日下午参拜了祭有甲级战犯的靖国神社。小泉自执政以来，一再表示要在8月15日──日本战败纪念日参拜靖国神社。他的这一态度遭到中国、韩国等亚洲国家以及日本国内各方人士的强烈反对。在这种情况下，小泉决定提前参拜靖国神社。
    1985年8月15日，当时的日本首相中曾根康弘参拜了靖国神社；1996年7月29日，当时的首相桥本龙太郎参拜了靖国神社。他们的举动遭到了日本舆论和邻国的强烈反对。

    2003年11月29日，日本间谍卫星发射失败。
    11月29日，载有两颗间谍卫星的H2A火箭从日本鹿儿岛县种子岛宇宙中心发射升空。这枚运载火箭在发射升空后不久出现故障，地面控制人员立即引爆了这枚火箭。新华社发据日本媒体报道，日本政府决定从2005年度开始研究第四代间谍卫星，目的是强化监视朝鲜核设施，使间谍卫星小型化，进一步提高机动性，对地面进行拍摄时在有限的最佳摄影瞬间拍摄更多的图像。
    决定开发第四代间谍卫星说明了日本建立自己独立情报系统的决心。日本2003年3月28日把两颗间谍卫星送上太空，表明日本在情报方面希望摆脱依赖美国的局面，向建立独立情报系统迈出了关键的一步。

    2004年1月19日，日本自卫队开始驻扎伊拉克。
    日本支持美国发动伊拉克战争，小泉政府于2003年批准向伊拉克派遣550人左右的地面部队。并于2004年1月开始向伊拉克南部派遣陆上自卫队，从事人道救援任务。这是日本自二战以来的首次重大海外军事任务。

    2005年1月3日，多次来华谢罪的日本老兵东史郎病逝，享年九十五岁。
    东史郎先生于1912年出生，原为侵华日军第十六师团二十联队士兵，1937年应召参加了侵华战争和南京大屠杀。战后，由于人性的复苏，东史郎对自己的加害行为充满悔恨，真诚地向中国人民反省谢罪，并勇敢地在日本各地集会上发表演讲，揭露日军南京大屠杀的暴行。1987，东史郎公开了自己的战时日记，并在南京大屠杀事件发生五十周年之际专程到南京反省谢罪。

    2005年2月26日，日本H2A型火箭在日本鹿儿岛县种子岛宇宙中心发射升空。
    2月26日 日本发射的H2A型火箭搭载的“向日葵6号”气象多用途卫星进入高度为3.6万公里的同步轨道，这标志着日本宇宙航空研究开发机构此次航空尝试的成功。预计5月底，这颗卫星将开始进行气象观测。
    日本H2A型火箭计划从2006年开始将转为民营化，从设计、制造到发射，均由日本著名军工企业三菱重工业公司负责，在体制上和欧美管理体制相同，意在调动民间资金发展日本航天业。日本载人航天飞行正在制定雄心勃勃的计划，2002年6月，日本政府曾决定调整航天技术开发重点，放弃载人飞船的开发，决定在10年内不单独实施载人航天计划，只通过参与国际空间站等合作项目积累技术。