1901年10月2日，郑士良等发起惠州起义。
    惠州起义，又称“庚子惠州之役”。1900年，当义和团在北方蓬勃发展，唐才常在华中策划起义之时，孙中山决意加紧在广东起义。他派郑士良前往惠州，联络会党以谋发动，并派史坚如至广州策动相应。
    10月，郑士良率领会党群众600余人在惠州三洲田山寨起义，连败清军，占领了清安、大鹏至惠州、平海一带沿海地区，起义队伍迅速扩展到2万人。为了取得孙中山在日本订购的一批军火，起义军向厦门进军。这时，日本新任首相伊藤博文突然改变了对华政策，下令禁止日本军火出口，并不准孙中山等革命党人在台湾活动，破坏了孙中山自海外接济起义军的计划。起义军血战半月以后，弹尽援绝，不得已，郑士良只好按照孙中山的指示，将大部分起义军解散，率一部分随从逃避香港。

    1907年5月27日，黄冈起义失败。
    5月27日，潮州黄冈反清起义军受官兵两面夹攻，力战不敌，于5月27日解散队伍。首领陈涌波、余丑等200余人由水路退往香港。1906年6月，革命党人、潮州富商许雪秋受孙中山指示，在广东潮州一带联络反清志士，筹划起义。后孙中山又嘱其候惠、钦、廉3州一同动作，许于是逗留香港等候时机。在这期间，黄冈起义的准备工作引起官兵警觉，官兵准备搜查起义骨干余通开的杂货店。陈涌波、余丑等人决定先发制人，于5月22日晚集众千余人起事，与官兵激战一夜，占领黄冈。
    23日，义军成立军政府，以“广东国民军大都督”名义宣布同盟会的革命宗旨。义军队伍一度增至5000余人。许雪秋接报后急派助手到黄冈，但清廷大批援军亦已赶到。
    义军失败后，官兵得义军遗落的名册，大肆捕杀党人。

    1907年12月2日，镇南关起义爆发。
    1907年(清光绪三十三年)12月2日，同盟会会员黄明堂、关仁甫率乡勇80人，携带快枪42杆，潜袭广西镇南关。3日，孙中山亲率黄兴、胡汉民、日人池亨吉、法国退职炮兵上尉狄氏等至关，登上炮台，全军鼓舞，黄明堂奏乐欢迎。
    7日，军机处将失去镇南关的张鸣岐“交部议处”，又命他戴罪立功“即日克复”。清军以4000人的兵力围攻。当夜，陆荣廷向北台猛扑，黄明堂坚持数日，枪弹告罄，于8日夜弃台，退至安南燕子大山。孙中山从越南运送的枪弹在文登即被法方扣留。镇南关起义遂告失败。
    本年为农历丁未年，此次起义又称“丁未镇南关之役”。

    1908年4月30日，云南河口起义。
    孙中山在西南边境筹划的第六次起义。1980年（光绪三十四年）4月30日，黄明堂受孙中山委派率义军二百余人从越南边界渡河向河口进攻，清军防营一部起义响应，革命军胜利攻占河口，杀河口副督王镇邦，得枪千余支，子弹七万发，黄以"中华国民军南军都督"名义布告安民，5月1日，关人甫率义军四百人左趋曼耗，拟取蒙自，一路连克巴河、田防、安定、新街、万河等地。王和顺亦率义军占领南溪。清云贵总督锡良闻警，一面急调署蒙自关道增厚及开广镇总兵白金柱率军南下救援，一面频电清廷告急，孙中山见河口起义多为清军变兵，前线又缺得力主将指挥，乃派黄兴为云南国民军怀念，赴前线督师。7日黄兴衔命前往，促黄明堂沿滇越铁攻昆明。黄明堂担心粮食不继，犹豫迟疑，黄兴遂亲率一军前往，中途队伍溃散。黄兴乃云河内召集钦州起义人员组队再赴前敌，11日行至老街被越南法国殖民当局扣押驱逐出境，当局又封锁中越边关，禁阻起义人员及粮械入滇，河口革命军陷入孤立无援的困境，锡良得以乘机调清军围攻，26日清军攻陷河口，黄明堂率义军六百余人突围撤入越南，被法国殖民当局勒逼缴械，强行遣散，历时一月的河口起义失败。