1961年4月16日，古巴反政府武装猪湾登陆失败。
    4月12日夜间，美国B-56型轰炸机从尼加拉瓜的基地起飞，为入侵提供空中支持。48小时后，一支约1400人的部队（大部分是受过一定训练的平民）在猪湾登陆。他们遭遇到比预料更强大的古巴防御力量，接着发生了猛烈的战斗，美国进一步的军事支援没有到来。使事情更糟的是预期古巴国内会爆发的反叛没有实现。入侵是一次彻底的失败，在72小时内就被击溃。战斗在猪湾留下了狼藉满地的瓦砾堆。尽管美、苏代表在6月的维也纳首脑会议上似乎显得很友好。两国关系因猪湾事件变得极度紧张。
    肯尼迪政府就任仅三个月后就在对古巴岛的入侵企图中陷入了危机。肯尼迪在1960年11月当选时发现，中央情报局一直在危地马拉训练一支由古巴流亡者组成的小规模军队，目的在于入侵古巴，推翻菲德尔-卡斯特罗的革命政权。虽然肯尼迪对这一计划有所疑虑，但仍允许将其付诸实行，其后果却构成了他任总统期间最大的耻辱之一。